巫山机场已开通了“重庆—巫山”、“重庆—巫山—烟台”、“巫山—广州”、“西安—巫山—海口”、“重庆—巫山—深圳”、“重庆—巫山—杭州”、“成都—巫山—武汉”、“昆明—巫山—烟台”等地航线。
“昆明—巫山—烟台”是2021年新开通的航线，由瑞丽航空执飞，每周一、三、五、七均有航班。“昆明—巫山—烟台”航班号为DR5359,1315从昆明长水机场出港，1500抵达巫山机场，1550从巫山机场出港，1750抵达烟台蓬莱机场。“烟台—巫山—昆明”航班号为DR5360，1850从烟台蓬莱机场出港，2100抵达巫山机场，2200从巫山机场出港，2355抵达昆明长水机场。
